Общецерковная аспирантура и докторантура имени святых равноапостольных Кирилла и Мефодия (ОЦАД) была основана решением Священного Синода Русской Православной Церкви 31 марта 2009 года по инициативе Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла. Общецерковная аспирантура и докторантура стала преемницей филиала аспирантуры Московской духовной академии, действовавшего при Отделе внешних церковных связей (ОВЦС) с 1963 года.
Ректором ОЦАД был назначен председатель ОВЦС епископ (впоследствии митрополит) Иларион (Алфеев). Обязанности председателя Наблюдательного совета аспирантуры и докторантуры принял на себя Святейший Патриарх Кирилл.
В июле 2009 года Синод утвердил Устав новосозданного учебного заведения, перед которым теперь стояли широкие и важные задачи. Для повышения уровня церковных научных исследований было необходимо организовать систему подготовки кадров высшей церковно-научной квалификации – докторов богословия. Кроме того, сохранялась задача, стоявшая перед аспирантурой при ОВЦС – специализированная подготовка управленческих и церковно-дипломатических работников.
Особое внимание Общецерковной аспирантуре уделяет председатель наблюдательного совета духовной школы – Святейший Патриарх Кирилл. В конце первого учебного года Общецерковной аспирантуры, в мае 2010 года, Патриарх встретился с учащимися и лично побеседовал с каждым из них.
В сентябре 2009 года состоялся первый набор обучающихся на программы аспирантуры, докторантуры и повышения квалификации. В 2010 году была открыта магистерская программа «Внешние церковные связи» и был проведен первый набор студентов на эту программу.
Первый этап существования ОЦАД был связан, в первую очередь, с организацией учебного процесса, развитием научной деятельности и созданием материально-технической базы.
В 2009-2010 учебном году ОЦАД располагалась в Отделе внешних церковных связей, летом 2010 года учебная деятельность переместилась в самый центр первопрестольного града, в Черниговское патриаршее подворье храмов Усекновения главы Иоанна Предтечи под Бором и святых мучеников Михаила и Феодора Черниговских в Черниговском переулке. Последующие годы велась реставрация зданий подворья с целью его восстановления и приспособления для нужд учебного процесса.
В марте 2011 г. ОЦАД получает бессрочную лицензию на осуществление образовательной деятельности.
9 ноября 2011 года решением Святейшего Патриарха Кирилла был учрежден Общецерковный совет по защите диссертаций на соискание ученой степени доктора богословия. Совет был совместным для Общецерковной аспирантуры и докторантуры, Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета, Московской и Санкт-Петербургской духовных академий и охватывал две научные специальности: богословие и церковная история.
С самого начала одним из приоритетных направлений деятельности ОЦАД стало развитие сотрудничества с высшими учебными заведениями России и зарубежных стран. В апреле 2010 года был подписан договор о сотрудничестве с Московским государственным лингвистическим университетом, в последующие годы соглашения о сотрудничестве были подписаны с Российским государственным социальным университетом, Высшей школой экономики, Российской академией народного хозяйства и государственной службы, Дипломатической академией МИД России и другими ВУЗами. В марте 2011 года было заключено первое соглашение о сотрудничестве с зарубежным высшим учебным заведением – Фрибургским университетом в Швейцарии. В первые годы существования ОЦАД ее партнерами стали также Свободный университет Амстердама (Нидерланды), Католический университет Лувена (Бельгия), Университет Упсалы (Швеция), Свято-Владимирская православная семинария (США).
В 2012 году на базе ОЦАД была создана Комиссия по регулированию студенческого обмена, призванная обеспечивать взаимодействие с зарубежными образовательными и научными учреждениями по вопросам академического сотрудничества, студенческого и преподавательского обмена.
Еще одним направлением международного сотрудничества ОЦАД стали гостевые лекции представителей Поместных Православных Церквей, иных христианских традиций, дипломатического корпуса, научных учреждений. ОЦАД посещали с гостевыми лекциями митрополит Диоклийский Каллист (Уэр), Архиепископ Кентерберийский Джастин (Уэлбли), Патриарх Сиро-Яковитской Церкви Мар Игнатий Ефрем II, послы иностранных государств.
В декабре 2011 года были проведены первые курсы повышения квалификации для новопоставленных архиереев. В этом же году ОЦАД начинает реализовывать краткосрочные программы повышения квалификации для церковных работников, ежегодно проводится несколько таких программ в сотрудничестве с профильными синодальными отделами.
В октябре 2013 года ОЦАД была проведена первая международная научно-богословская конференция «Преподобный Исаак Сирин и его духовное наследие», положившая начало многолетнему циклу международных конференций, посвященных наследию того или иного отца Церкви. В последующие годы конференции были посвящены преподобному Симеону Новому Богослову, преподобному Иоанну Кассиану, священномученику Иринею Лионскому, преподобному Ефрему Сирину, святителю Василию Великому и святителю Амвросию Медиоланскому. Каждая из них собирала в стенах ОЦАД ведущих исследователей святоотеческого наследия из России и зарубежных стран.
В 2014 году ОЦАД было положено начало традиции присуждения степени доктора honoris causa выдающимся деятелям Православной Церкви и иных христианских традиций. Почетными докторами ОЦАД стали Святейший Патриарх Кирилл, митрополит Диоклийский Каллист (Уэр), ряд видных ученых и церковных деятелей современности.
В 2014 году ОЦАД был начат проект по проведению летних институтов – краткосрочных программ культурно-академического обмена для знакомства с устроением и служением Русской Православной Церкви, а также с историей и традициями разных христианских стран и конфессий. В работе этих институтов участвовали представители Поместных Православных Церквей, Римско-Католической Церкви, Ассирийской Церкви Востока, Церкви Англии и нескольких благотворительных христианских фондов.
16 декабря 2014 года в Патриаршей резиденции Данилова монастыря под председательством Святейшего Патриарха Кирилла состоялось заседание Наблюдательного совета ОЦАД. В своем вступительном слове Святейший Патриарх, в частности, отметил:
«Общецерковная аспирантура и докторантура … несомненно, призвана консолидировать интеллектуальные ресурсы Русской Православной Церкви, генерировать новые общественные идеи, осуществлять непрерывное образование ответственных сотрудников Церкви, служить площадкой для диалога церковной и светской науки».
2015 год в истории ОЦАД ознаменовался завершением основного этапа реставрации зданий Черниговского патриаршего подворья. 1 ноября 2015 года Святейший Патриарх Кирилл совершил великое освящение храма в честь Усекновения главы святого Иоанна Предтечи под Бором. В тот же день Патриарх посетил новый учебный корпус ОЦАД по адресу ул. Пятницкая, дом 4/2, строение 1, реставрация которого также была завершена.
В 2015 г. на базе ОЦАД был открыт издательский дом «Познание», ориентирующийся на тематику древней и современной христианской духовной культуры. Один из основных издательских проектов ОЦАД - подготовка учебников для бакалавриата высших духовных учебных заведений Русской Православной Церкви. В рамках этого проекта на базе ОЦАД объединили усилия ведущие преподаватели духовных школ Русской Православной Церкви и светских высших учебных заведений.
ОЦАД играла значимую роль в становлении теологии как научной специальности в России. 30 мая 2016 года приказом Министерства образования и науки России был создан первый в России Объединенный диссертационный совет по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата и доктора наук по специальности «Теология» на базе Общецерковной аспирантуры и докторантуры, Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета, Московского государственного университета и Российской академии народного хозяйств и государственной службы.
В 2017 году по благословению Святейшего Патриарха Кирилла на базе ОЦАД был создан Кандидатский диссертационный совет по защите диссертаций на соискание богословской степени кандидата богословия.
В 2017 году была проведена первая Всероссийская конференция «Теология в научно-образовательном пространстве», организатором которой выступила ОЦАД.
7 февраля 2018 года приказом Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки ОЦАД получила государственную аккредитацию по направлению подготовки «Теология» на 2 высших уровнях образования (магистратура и аспирантура) с правом выдачи диплома государственного образца. С 1 марта 2022 года государственная аккредитация постановлением Правительства РФ стала бессрочной.
15 февраля 2018 года была создана Научно-образовательная теологическая ассоциация, учредителем которой стала Общецерковная аспирантура и докторантура совместно с ведущими ВУЗами страны. НОТА стала научно-методическим и экспертным центром в сфере теологии, который объединяет усилия российских ВУЗов по возвращению теологии в российское образовательное пространство.
В 2018 году завершился второй этап реставрации Черниговского патриаршего подворья и 11 марта 2018 года Святейший Патриарх Кирилл совершил чин великого освящения храма святых мучеников Михаила и Феодора Черниговских. В своем слове Патриарх Кирилл отметил:
«Радуюсь успехам нашей Общецерковной аспирантуры и докторантуры и надеюсь, что она будет в полной мере развивать все то, что Церковь сегодня считает важным, - для того, чтобы мир уверовал, для того, чтобы языком богословия Церковь научилась говорить с теми, кто, к сожалению, еще не воспринимает голос церковной проповеди, помогая им видеть в отеческом придании, Священном писании, святоотеческих творениях ту великую вечную мудрость, опираясь на которую мы можем актуализировать древнее, но всегда юное Божественное откровение».
В 2018 году ОЦАД совместно с Высшей школой экономики начала реализацию двух магистерских программ – «Каноническое право» и «Философия и история религии». Магистерская программа «Каноническое право» реализовывалась совместно с магистерской программой Высшей школы экономики «Церковь, общество и государство. Правовое регулирование деятельности религиозных объединений», а магистерская программа «Философия и история религии» – совместно с магистерской программой Высшей школы экономки «Философия и история религии».
30 сентября 2021 года был открыт культурно-просветительский центр «Книжная палата в Черниговском». Этим событием завершились многолетние работы по реставрации зданий Черниговского подворья.
В 2021 году ОЦАД впервые выступила соорганизатором Форума молодых теологов, ставшего ежегодным научным мероприятием для студентов духовных школ и светских ВУЗов.
7 июня 2022 года решением Священного Синода ректором Общецерковной аспирантуры и докторантуры был назначен председатель Учебного комитета Русской Православной Церкви протоиерей Максим Козлов. В интервью РИА Новости протоирей Максим, в частности, сказал:
В связи с изменениями в перечне научных специальностей, по которым присуждаются ученые степени, 28 ноября, вместо Объединенного диссертационного совета по теологии был открыт Объединенный совет по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата и доктора наук по научным специальностям (по исследовательскому направлению: православие): теоретическая теология, историческая теология и практическая теология. Новый совет был создан на базе Общецерковной аспирантуры и докторантуры, Московского государственного университета и Московской духовной академии.
В 2022 году также была проведена реорганизация церковных диссертационных советов в соответствии с благословением Святейшего Патриарха Кирилла.
6 декабря 2022 года Президиум Совета ректоров ВУЗов Москвы и Московской области рассмотрел и одобрил заявку Общецерковной аспирантуры и докторантуры о ее включении в Ассоциацию московских ВУЗов. Ректор ОЦАД протоиерей Максим Козлов был введен в состав Совета ректоров ВУЗов Москвы и Московской области.
В декабре 2022 ОЦАД и Высшая школа экономики отметили десятилетие плодотворного сотрудничества.
С декабря 2022 года научно-богословский журнал «Церковь и время», издававшийся с 1991 года Отделом внешних церковных связей Московского Патриархата, стал совместным журналом ОЦАД и ОВЦС. Первый номер журнала в обновленном формате вышел в 2023 году.
4-5 апреля 2023 года в ОЦАД прошла Первая междисциплинарная научная конференция «Церковь и время» на тему «Бог в русской мысли, культуре, истории».
16 мая 2023 года решением Священного Синода Русской Православной Церкви была открыта новая магистерская программа ОЦАД «Историческая литургика», первый набор на которую состоится в 2024 году.
2022-2023 учебный год ознаменовался укреплением сотрудничества ОЦАД с высшими духовными учебными заведениями Русской Православной Церкви, а также со светскими ВУЗами. В течение этого учебного года были заключены договоры о сотрудничестве со Сретенской духовной академией, Псково-Печерской, Оренбургской, Смоленской и Тамбовской духовными семинариями.
Следуя мысли Святейшего Патриарха, выраженной в его поздравлении ОЦАД по случаю актового дня 3 октября 2022 г., Общецерковная аспирантура и докторантура стремится
«быть центром богословской науки, площадкой для реализации различных проектов с привлечением ученых, деятелей культуры и образования».